Windows 98 Segunda Edição (muitas vezes abreviado para SE) é uma versão actualizada do Windows 98, liberada em 5 de maio de 1999. Ele inclui correções para muitas questões menores, melhor suporte USB, e à substituição do Internet Explorer com os 4,0 significativamente mais rápido e mais leves Internet Explorer 5. E ainda tem compartilhamento de conexão da internet, que permite que vários computadores em uma LAN para compartilhar uma única conexão à Internet através da Network Address Translation.